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預(yù)測羥基芫花素肝毒性風(fēng)險

返回列表 來源:未知 發(fā)布日期:2019-10-15 13:29【

芫花( Genkwa Flos ) 為瑞香科植物芫花( Daphnegenkwa Sieb. et Zucc. ) 的干燥花蕾。其功能為逐水 滌痰,主要用于治療胸脅停飲、腫脹腹水、喘咳引 痛等疾病。研究表明,芫花具有鎮(zhèn)咳、祛 痰、 抗腫瘤和免疫調(diào)節(jié)等藥理作用。由于其明確的抗 腫瘤活性,臨床長期應(yīng)用所導(dǎo)致的不良反應(yīng)屢次 出現(xiàn),其中肝損傷所占比例最為嚴(yán)重,目前已 引起關(guān)注。

1 藥品與試劑

人肝微粒體( HLM,美國 BD Gentest 公司) ; 磷 酸鉀( 純度≥98% ) 、氯化鎂( 純度≥98% ) 、抗壞血 酸( 純度≥98% ) 、三羥甲基氨基甲烷( Tris,純度≥ 98% ,百靈威科技公司) ; 葡萄糖二酸單內(nèi)酯( 純度 ≥98% ) 、丙甲菌素( 純度≥98% ) 、尿苷二磷酸葡萄 糖醛酸( UDPGA,純度≥98% ) 、二甲基亞砜( DMSO, 純度≥98% ,Sigma Aldrich 公司) ; 膽紅素( 批 號: 100077-201206,含量: 99. 3% ) 、羥基芫花素( 含量 > 98% ,成都瑞芬思生物科技有限公司) ; 甲酸、鹽酸( 北京化學(xué)試劑廠,分析純) ; 乙腈、甲醇( Fisher 公 司,色譜純) 。

2 儀器

AcquityTM Ultra Performance LC 超高效液相色譜 儀( 美國 Waters 公司) ; AE240 電子天平( 瑞士梅特勒-托利多公司) ; SDC 6 節(jié)能職能恒溫槽( 寧波新芝生物科技股份有限公司) ; 17R 高速低溫離心機(jī) ( 美國 Thermo 公司) 。

3 同源模建

UGT1A1 是由 534 個氨基酸殘基組成的Ⅱ相代 謝酶,由于目前尚未確定 UGT1A1 的 N-末端結(jié)構(gòu) 域,因此采用 Discovery Studio 2. 5 BLAST Search 模 塊進(jìn)行序列比對,通過分析其同源性和相似性的高 低,選擇相似性較高的 4 種蛋白作為模板蛋白進(jìn)行 同源模建。采用 Modeller 9. 13 程序,基于逐級能量 最小化方法,約束所有重原子后,依次優(yōu)化氫原子, 優(yōu)化側(cè)鏈及 Loop 區(qū)。能量最小化過程采用最陡下 降法和共軛梯度法進(jìn)行優(yōu)化。最后基于拉氏圖和 Profile-3D 分析對同源模建蛋白進(jìn)行評價,最終構(gòu)建 出 UGT1A1 酶蛋白結(jié)構(gòu)。

4 分子對接實(shí)驗(yàn)

利用 Discovery Studio 2. 5 的 From Receptor Cavities 模塊對蛋白空腔進(jìn)行自動識別,并利用活性值 與打分值的相關(guān)性系數(shù)對活性口袋進(jìn)行評價,分析 待測單體羥基芫花素與 UGT1A1 酶蛋白的作用方 式,同時計算二者復(fù)合物結(jié)合自由能,用以判斷親和 作用強(qiáng)弱。

5 人肝微粒體體外抑制實(shí)驗(yàn)

5. 1 色譜條件

Acquity UPLC HSS C18柱( 100 mm × 2. 1 mm,1. 8 μm) ; 預(yù)柱: Acquity UPLC HSS C18 VanGuard Pre-column( 5 mm × 2. 1 mm,1. 8 μm) ; 流 動相: 乙腈( A) -0. 1% 甲酸水溶液( B) ,梯度洗脫 ( 0 ~ 2. 1 min,40% A→75% A; 2. 1 ~ 4. 2 min,75% A→95% A; 4. 2 ~ 8. 0 min,95% A; 8. 0 ~ 8. 5 min, 95% A→40% A; 8. 5 ~ 12. 5 min,40% A) ; 流速: 0. 4 mL·min - 1 ; 柱溫: 35 ℃ ; 檢測波長: 450 nm; 進(jìn)樣量: 10 μL。

5. 2 UDPGA-發(fā)生系統(tǒng)的制備

精密稱取氯化 鎂、葡糖二酸單內(nèi)酯、丙 甲 菌 素、UDPGA 適 量,用 Tris-HCl 緩沖液( 稱取 Tris 121. 1 g,加入去離子水 800 mL,加濃鹽酸調(diào) pH 至 7. 4,以去離子水定容至 1 000 mL) 使溶解,使含氯化鎂 5 mmol·L - 1,葡糖二 酸單內(nèi)酯 5 mmol·L - 1,丙甲菌素 25 μg·mL - 1,UDP-GA 5 mmol·L - 1,即得 UDPGA-發(fā)生系統(tǒng)。

5. 3 溶液的制備

采用已建立的人肝微粒體孵育 體系( HLM) ,測定羥基芫花素對 UGT1A1 酶 的抑制作用,以表觀抑制常 數(shù)( Ki ) 為評 價 指 標(biāo)。 取蛋白為 0. 5 mg·L - 1的 HLM 30 μL 放至室溫,復(fù) 融后,加入系列濃度的底物膽紅素對照品溶液 ( 0. 52 ~ 2. 37 μmol·L - 1 ) 及待測單體羥基芫花素對 照品溶液( 0. 38 ~ 12. 41 μmol·L - 1 ) ,置 37 ℃ 恒溫水 浴預(yù)孵育 3 min 后加入新鮮配制的 UDPGA-發(fā)生系 統(tǒng)溶液 68 μL 啟動反應(yīng)。反應(yīng) 10 min 后立即加入 600 μL 冰乙腈-甲醇( 2 ∶ 1,含抗壞血酸濃度為 200 μmol·L - 1 ) 終止反應(yīng),沉淀蛋白,渦旋 1 min,于 13 000 r·min - 1 ( r = 5 cm) 離心 25 min,取上清液即刻進(jìn) 行測定[體系終體積為200 μL,DMSO 總用量不超過 1% ( v / v) ]。

6 結(jié)果

利用 Discovery Studio 2. 5 的 From Receptor Cavities 模塊對 UGT1A1 蛋白空腔進(jìn)行自動識別,共獲 得 9 個口袋( A ~ I 活性口袋) ,坐標(biāo)及半徑如表 1 所示。

將單體羥基芫花素( 結(jié)構(gòu)見圖 1) 與 UGT1A1 酶 蛋白進(jìn)行對接,選擇能夠接納化合物且相關(guān)系數(shù)相 反數(shù)最大的口袋作為活性口袋。對接結(jié)果顯示,芫 花素在 site F 的打分值為86. 374 5,高于其他活性位點(diǎn)的打分值,因此羥基芫花素的結(jié)合口袋確定為 site F。

7 結(jié)論

研究首先通過分子對接技術(shù)構(gòu)建 UGT1A1 酶蛋 白結(jié)構(gòu),將待測單體羥基芫花素與 UGT1A1 酶蛋白 對接,明確二者結(jié)合靶點(diǎn)以及結(jié)合強(qiáng)弱,初步推測羥 基芫花素與 UGT1A1 酶的結(jié)合位點(diǎn)為活性區(qū) F,與 其底物膽紅素活性位點(diǎn)重合,但對接結(jié)果顯示羥基 芫花素與 UGT1A1 酶親和性較弱,因此提示羥基芫 花素對 UGT1A1 酶活性影響較小,潛在肝毒性風(fēng)險 小。另一方面,體外人肝微粒體實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,羥基 芫花素對人源 UGT1A1 酶具有弱抑制作用,抑制類 型為競爭型抑制,與計算機(jī)分子對接結(jié)果相一致。